中國海協會會長陳雲林5日晚間被抗議民眾圍困在晶華酒店，鎮暴警察於半夜1時30分展開驅離行動，淨空酒店前的街道。2點09分，陳雲林在國民黨主席吳伯雄陪伴及優勢警力保護下，從酒店側門搭車離去，並順利返回下榻的圓山飯店。

國民黨主席吳伯雄5日晚間宴請中國海協會會長陳雲林，數百名抗議民眾包圍晶華酒店，並佔據各出入車道，對離去賓客的轎車及部分電視台的SNG車吐口水及丟擲雞蛋。

包括陳雲林、吳伯雄及企業界等多位受邀賓客都受困於晶華酒店，抗議民眾也與警方爆發多起衝突，造成警民多人受傷。民進黨籍民意代表還到現場分送水及食物，鼓勵抗議民眾徹夜圍守。

在內政部長廖了以及警政署長王卓鈞坐鎮下，鎮暴警察於午夜1時30分手持盾牌，以推進的方式進行驅離，淨空晶華酒店前的中山北路。抗議民眾不斷衝撞，鳴放喇叭，並以水瓶或物品丟向鎮暴警察。由於陳雲林等人受困達7個多小時，海基會一度建議陳雲林及吳伯雄當晚留宿晶華酒店。

直到半夜2時09分，陳雲林才在吳伯雄陪伴及優勢警力保護下，從酒店側門搭車離去。離去時，一名男子突然撲上陳雲林座車的引擎蓋上，高喊「台灣獨立」，隨即被維安人員帶走。

至於陳雲林原本下榻的圓山飯店，晚間也有大批民眾前往圍堵，不斷高呼抗議口號及施放煙火，警方則張起防蛋網，防止民眾以雞蛋攻擊，抗議民眾直到深夜才陸續離去。